A Casa de Custódia e Tratamento de Taubaté desempenhou, ao longo de sua história, diversas funções. Foi instituto correcional para adultos, escola profissional para menores, reformatório, seção agrícola e casa de tratamento psiquiátrico. Atualmente é denominado Hospital de Custódia e Tratamento Psiquiátrico "Dr. Arnaldo Amado Ferreira" e é uma unidade prisional de segurança máxima. Com instalação iniciada em 1911, esteve, por muito tempo, associado ao Instituto Correcional da ilha dos Porcos, atual ilha Anchieta, recebendo daí detentos transferidos. De acordo com o tenente-coronel Lamarque Monteiro, durante a ditadura, a Casa recebeu 20 presos políticos que responderam a Inquéritos Especiais Militares. Dentre eles, Ivan Seixas, militante do MRT de 16 anos, detido ali entre novembro de 1974 e agosto 1976. A instituição ainda foi palco, em 1993, da fundação do PCC (Primeiro Comado da Capital), que teve como principais motivos as rígidas regras e o isolamento do CRP (Centro de Readaptação Penitenciária), pavilhão anexo inaugurado em 1985, e o massacre do Carandiru, ocorrido em outubro de 1992.
