Durante a ditadura civil-militar, o Cemitério Municipal do Lajeado recebia do Serviço Funerário Municipal corpos não reclamados pelas famílias e corpos considerados "não identificados" pelo Instituto Médico Legal. Ambos constituem o grupo dos popularmente chamados “indigentes”. Na época, a repressão tomou como prática alterar as identidades e enterrar como indigentes nos cemitérios municipais os militantes políticos que assassinava. Por essa razão, acredita-se que possa haver corpos de desaparecidos políticos no local. Agravam estas desconfianças os diversos incêndios ocorridos no local entre 1974 e 1985. Apesar de registrados como de origem criminosa, eles nunca foram investigados. Em uma das ocorrências, um funcionário do cemitério morreu carbonizado, salas de arquivos foram queimadas, perderam-se registros, listas de nomes de pessoas enterradas, fotografias e documentos do IML e do Serviço Funerário. O cemitério segue em funcionamento.
